По моему скромному мнению, святость Бога сильнее человеческих заблуждений. Места на земле, где Бог являлся лично, самим Его присутствием освящены на веки вечные. Если на таком месте заблуждающиеся люди возвели какое-то строение, оно от этого не перестало помнить Бога и быть святым для нас, христиан.
В моём понимании, митрополит молился и возжёг лампаду именно в таких святых местах, где происходили (к сведению комментаторов) величайшие события в истории человечества - земная жизнь, распятие и воскресение самого Бога - Господа нашего Исуса Христа. Какое место может быть более свято? Мне жаль тех, кто в подобных местах видит прежде всего синагогу.